超额收益套利需要严格的资金管理，按照套利组合持有周期长短的不同，我们将超额收益套利交易的资金管理分为两类情况进行分析：
持有期在四周以内
对于持有期较短的套利策略，可根据历史价格波动确定一个安全的期货资金额度。具体方法如下：
1.根据历史价格统计一下股指周度涨幅数据，比如可以按照一周、两周、三周与四周的时间跨度计算涨幅最大值、最小值与平均值。
2.选择一个合适的涨幅值用于期货资金的计算，主要考虑两点：所选数据的时间跨度尽量与套利组合持有期相匹配，比如套利组合持有期为两周，则可以选用两周最大涨幅值作为计算参数；可以根据当前行情特征则机选择是采用最大值、最小值还是平均值，建议如果行情处于上涨走势中尽量选择最大值，如果行情走势较为平缓可以选择平均值，行情处于下跌势则可以选择平均值或比平均值稍低，对于最小值则尽量不选择。
3.期货资金数额的计算公式为：期货合约价格×合约乘数×合约数量×（交易保证金比率+涨幅值）。
4.考虑到在价格上涨情形下结算保证金绝对值会增加，需要对上述公式进行一定的调整。
调整后的资金计算公式为：期货合约价格×合约乘数×合约数量×（交易保证金比率+涨幅值×（1+18%）），仍假设期货合约价格为3000点，合约乘数为300元/点，合约数量为1手，期货交易保证金为18%，选取历史价格二周最大涨幅值13.36%作为计算参数，则期货账户上配置的资金为：3000×300×1×（18%+13.36%×（1+18%））=303883.2元。
持有期在四周以上
对于套利组合持有期在四周以上的策略主要面临资金风险在于：持有期过长股指价格波动幅度会很大，如果期货账户备用资金过少会发生强平风险，而备用资金放置过多则会降低资金利用效率。
对于持有期较长的套利交易，期货交易会进行多次换月交易，持仓换月一方面会增加交易费用、降低套利收益，但如果价差呈现远月升水，则空头持仓换月会带来收益。所以持有期长的套利可以选择当月合约临近交割跨期价差保持升水时换仓到次月合约，同时对期货账户资金进行检查，如果可用资金不高，则向期货账户注资。
当月合约存续期为四周，所以在建仓初始可以根据历史价格四周涨幅值确定一个期货账户可用资金额度，期货账户总资金量为：期货合约价格×合约乘数×合约数量×（交易保证金比率+涨幅值×（1+18%）），其中扣除掉保证金的部分即为可用资金资金。
在期货合约换月时，根据新的价格以及采用的涨幅值重新计算可用资金量，如果账户实际可用资金小于该值时，需要补充差值。
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